黑臭是外來有機污染超量排放，內源污染持續釋放導致的一種極端現象，是由于水體缺氧，有機物腐敗而造成的。其理化環境表現為強還原性質，有機無機污染極其嚴重，水體有異味，已經不適合水生生物生存，水生植被退化甚至滅絕，浮游植物、浮游動物、底棲動物只有少量耐污種存在。

水體富營養化是指在人類活動的影響下，生物所需的氮、磷等營養物質大量進入湖泊、河湖、海灣等緩流水體，引起藻類及其他浮游生物迅速繁殖，水體溶解氧量下降，水質惡化，魚類及其他生物大量死亡的現象。在自然條件下，湖泊也會從貧營養狀態過渡到富營養狀態，不過這種自然過程非常緩慢。而人為排放含營養物質的工業廢水和生活污水所引起的水體富營養化則可以在短時間內出現。水體出現富營養化現象時，浮游藻類大量繁殖，形成水華（淡水水體中藻類大量繁殖的一種自然生態現象）。因占優勢的浮游藻類的顏色不同，水面往往呈現藍色、紅色、棕色、乳白色

藍藻又名藍綠藻（blue—green algae），是一類進化歷史悠久、革蘭氏染色陰性、無鞭毛、含葉綠素a，但不含葉綠體(區別于真核生物的藻類)、能進行產氧性光合作用的大型單細胞原核生物。與光合細菌區別是：光合細菌(紅螺菌)進行較原始的光合磷酸化作用，反應過程不放氧，為厭氧生物，而藍細菌能進行光合作用并且放氧。它的發展使整個地球大氣從無氧狀態發展到有氧狀態，從而孕育了一切好氧生物的進化和發展。已有120多種藍細菌具有固氮能力，特別是與滿江紅魚腥藍細菌(Anabaena azollae)共生的水生蕨類滿江紅

青苔與水草、其它藻類爭奪養分，過度消耗水體營養，破壞池塘正常的物質代謝，使養殖水體清瘦。水質清瘦的后果：水草生長受抑制；浮游生物生周期性生長被破壞導致水體藻相失衡…所有這些都會影響小龍蝦、蟹、魚的正常生長。

大面積浮萍的危害非常嚴重，它不僅遮擋住陽光使水體渾濁，還使大量有機物發生化學反應，使有毒細菌增多、氧氣減少，魚蝦不能生存，嚴重破壞河道生態環境。

黑苔產生原因多數是因為底泥中污染物質過多，水體有機營養物過于旺盛所導致，利用流洋苔藻治理技術即可解決問題

人工濕地是由人工建造和控制運行的與沼澤地類似的地面，將污水、污泥有控制的投配到經人工建造的濕地上，污水與污泥在沿一定方向流動的過程中，主要利用土壤、人工介質、植物、微生物的物理、化學、生物三重協同作用，對污水、污泥進行處理的一種技術。